Je ne vois pas l'intéret de perdre du temps à refaire toute la config du serveur alors que l'actuelle fonctionne très très bien, tout étant entièrement automatisé.    
En plus la transition de serveur sera bcp plus fastidieuse si la configuration n'est pas identique.  
En conservant la configuration , la transition prend tout au plus une heure de downtime si tous les fichiers ont été transférés à l'avance (je l'ai déjà fait 4-5 fois je commence à savoir comment ça va)

En ce qui concerne webmin, je ne l'ai jamais personellement utilisé parce que je vais beaucoup plus vite en console mais je suppose que c'est une question de gout.  En tout cas pour l'ajout de compte il vaut mieux utiliser le script que j'avais fait, et ce afin d'avoir un hébergement standardisé pour tout le monde (fallait voir le bordel qu'il y avait sur le serveur quand j'ai repris l'informatique et que rien n'était encore automatisé)

Je veux bien m'occuper de la transition, Si tous les fichiers ont été transférés au préalable (le plus intéressant est un rsync en ayant recopié le /etc/passwd et le /etc/shadow afin de conserver les users)
Quand tout est transféré un fois, il suffit de refaire un rapide rsync juste avant de la transition pour mettre transférer les derniers fichiers modifiés.